进一步通过GO和KEGG富集分析,对差异基因的功能进行描述。构建lncRNAs-mRNAs共表达网络、lncRNAs-miRNAs

进一步通过GO和KEGG富集分析,对差异基因的功能进行描述。构建lncRNAs-mRNAs共表达网络、lncRNAs-miRNAs-mRNAs互作网络以及lncRNA与转录因子关联网络,综合分析差异表达的lncRNAs在TBI中的调控作用。(二)TBI后凋亡变化及特定lncRNAs在氧化应激细胞模型中的表达大鼠TBI后行Western blot检测凋亡标志蛋白的变化。用H_2O_2诱导大鼠神经Dactolisib细胞株(PC-12,Manassas,VA,USA)构建体外模型,分别设100μmol/L,200μmol/L,400μmol/L H_2O_2处理组。采用CCK-8实验筛选H_2O_2有效作用浓度。处理氧化应激模型细胞0,3,6,12,24 h后,通过试剂盒检测过氧化氢酶(CAT)、活性氧(ROS),超氧化物歧化酶(SOD)含量,进行氧化应激水平的检测。在确定了最合购买SU5416适的H_2O_2的浓度以及处理的最佳时间后,通过q PCR检测特定的lncRNAs在氧化应激细胞模型中的表达水平。把在体内和体外均差异表达的lncRNA NONRATT017220.2命名为lncRNA-TBIAT,利用Targetscan数据库与miRTar Base数据库预测可能调控的miRNAs,以便于进一步机制验证。(三)lncRNA-TBIAT调控神经细胞氧此网站化应激及凋亡的作用机制研究PC-12细胞用于细胞转染实验研究。设置正常对照组,阴性对照组,siRNA干扰组。转染前需准备质粒,待细胞生长达60%融合时转染siRNA-lncRNA-TBIAT。q PCR验证siRNA-lncRNA-TBIAT的干扰效果,接着CCK-8检测敲低lncRNA-TBIAT后对细胞活性的影响。利用流式细胞术检测细胞凋亡情况,接着通过荧光显微镜检测ROS水平,通过CAT和SOD活性检测试剂盒检测CAT和SOD的活性的变化。

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